ONT PromethION24
解析概要
Oxford Nanopore Technologies社のPromethION24を使用して塩基配列を解析するサービスです。
R9.4.1フローセル、R10.4.1フローセルのどちらにも対応しています。
原則としてライゲーションでアダプターを付加するキットを使用します。
提出サンプル要件
DNAシーケンス解析
2 µg以上のDNA
- サンプルは原則として1.5 mlチューブに入れてください。
※DNA LoBind tubeを推奨しています。 - 1.5 mlチューブには名前とredmine（SignAC依頼システム）で発行されるチケット番号、サンプルNo.（サンプルが複数ある場合）を記入してください。
納品物
POD5/fastqファイル
- Output：25～100 Gbase ※データ量の保証はできません。
- 1フローセルあたりの納品になります。
- 原則として、fastqファイルは、最新版MinKnowデフォルトのBasecallerでbasecall (High accuracy mode)して生成します。
- 5mC detectionもご相談ください。
- 簡単な一次解析（mappingなど）もご相談ください。
納期
お問い合わせください。
参考
キットの在庫がある場合は1～3週間程度、ない場合は3～4週間程度（2022年度実績）