PacBio トランスクリプトーム解析（Kinnex full-length RNA）
解析概要
トータルRNAを提出いただき、PacBio社のKinnex full-length RNA kitを用いて、MAS-Seq連結法による8連結全長cDNAライブラリーを調製し、Revioシステムでシーケンス解析を実施するサービスです。納品データは連結アダプター配列部分でsegmentationされたHiFiリードになります。
- 内規上の名称：
Kinnex-full length RNAライブラリーの調製とシーケンス解析
Kinnex-full lengthライブラリーの調製のみ
サンプル要件
700 ngのtotal RNA
- サンプル量が少ない場合はご相談ください。
- ≥7.0RIN
- サンプルは原則として1.5 mlチューブに入れてください。
DNA Low bind tubeを推奨しています。
- 1.5 mlチューブには名前とredmine（SignAC依頼システム）で発行されるチケット番号、サンプルNo.（サンプルが複数ある場合）を記入してください
納品物
hifi_reads.bam、または、SMRT Link解析ワークフローで得られるsegmentationされたHiFiリードbamファイル（segmented.bamファイルなど）
- Output：segmentation後、1500万リード/4500万リード
データ量の保証はできません。
- シーケンス部分は、1セル単位 の解析サービス になります。「ライブラリー調製のみ」を追加して、１セルの中で複数ライブラリーをマルチプレックス解析することも可能です。
- 簡単な一次解析(mappingなど)もご相談ください。対応が可能な場合があります。
納期
お問い合わせください。
参考
キットの在庫がある場合は1～3週間程度、ない場合は3～4週間程度（2022年度実績）