PacBio トランスクリプトーム解析（Iso-seq）
解析概要
トータルRNAを提出いただき、全長RNAライブラリー（Iso-seqライブラリー）を調製し、Sequel IIeまたはRevioシステムでHiFiリードを生成するサービスです。
- 内規上の名称：
RNAライブラリーの調製とシーケンス解析
RNAライブラリの調製のみ
サンプル要件
700 ngのtotal RNA
- サンプル量が少ない場合はご相談ください。
- ≥7.0 RIN
- oligo dTプライマーによる逆転写を実施するため、ポリAを持たない生物のRNAは解析できません。
- サンプルは原則として1.5 mlチューブに入れてください。
DNA Low bind tubeを推奨しています。
- 1.5 mlチューブには名前とredmine（SignAC依頼システム）で発行されるチケット番号、サンプルNo.（サンプルが複数ある場合）を記入してください
納品物
hifi_reads.bamファイル
- Output：～200万リード/～600万リード
データ量の保証はできません。
- シーケンス部分は、1セル単位の解析サービス になります。「ライブラリー調製のみ」を追加して、１セルの中で複数ライブラリーをマルチプレックス解析することも可能です。
- 簡単な一次解析（mappingなど）もご相談ください。対応が可能な場合があります。
納期
お問い合わせください。
参考
キットの在庫がある場合は1～3週間程度、ない場合は3～4週間程度（2022年度実績）