ONT Direct RNAシーケンス解析
解析概要
トータルRNAまたはpolyA+ RNAを提出いただき、Oxford Nanopore Technologies社Direct RNA Sequencing Kit （SQK-RNA004）を用いてライブラリーを調製し、RNA用フローセル（FLO-PRO004RA）1回ロードしてシーケンスを実施し、シーケンスデータを納品するサービスです。
PCRによる増幅バイアスなくRNAの配列を解析することができます。RNAの塩基修飾も解析可能です。
wash、再ロードはご利用いただけません。
- 内規上の名称：
Direct RNAシーケンス解析
サンプル要件
20 μL中に750 ngのpoly(A)+RNAまたは2.5 μgのtotal RNA
- サンプル量が少ない場合はご相談ください。
- poly(A)+RNAの提出を推奨
- 原則としては、oligo dTプライマーによる逆転写を実施するため、ポリAを持たない生物のRNAは解析できません。
- サンプルは原則として1.5 mlチューブに入れてください。
DNA Low bind tubeを推奨しています。
- 1.5 mlチューブには名前とredmine（SignAC依頼システム）で発行されるチケット番号、サンプルNo.（サンプルが複数ある場合）を記入してください
納品物
POD5/fastqファイル
- Output：500〜2000万リード
データ量の保証はできません。
- 1フローセルあたりの納品になります。
- 原則として、fastqファイルは、最新版MinKnowデフォルトのBasecallerでbasecall (High accuracy mode) して生成します。
- 一部の塩基修飾検出については対応可能な場合があります。
納期
お問い合わせください。
参考
キットの在庫がある場合は1～3週間程度、ない場合は3～4週間程度