Oxford Nanopore Technologies (ONT) PromethION24 概要
Oxford Nanopore Technologies社のPromethION24を使用して塩基配列を解析するサービスです。R10.4.1フローセルのみに対応しています。提出するサンプルの種類、性質の違いや、解析の目的に応じた、以下の6つの解析アプリケーションを提供しています。
(1)ONT ウルトラロングリードDNA解析
- 内規上の名称:
ウルトラロングリードDNA解析
(2)ONT LigationキットDNA解析
- 内規上の名称:
SQK-LSK114とPromethION24による断片化DNAのシーケンス解析
SQK-LSK114による断片化DNAのライブラリ調製
(3)ONT RapidキットDNA解析
- 内規上の名称:
Rapid Sequencing kitとPromethION 24によるDNAシーケンス解析
Rapid Sequencing kitによるDNAライブラリ調製
(4)ONT Direct RNAシーケンス解析
- 内規上の名称:
Direct RNAシーケンス解析
(5)ONT シーケンス解析のみ(調製済みライブラリのシーケンスランのみ)
- 内規上の名称:
DNAシーケンス解析(調整済みDNAライブラリーのシーケンスランのみ)
(6)ONT フローセル洗浄とライブラリ再ロード
- 内規上の名称:
フローセル洗浄とライブラリー再ロード
「(2)Ligation Sequencingキット」, 「(3)Raipd Sequencingキット」のアプリケーションについては、ライブラリー調製のみの委託と、ライブラリー調整からシーケンス解析までの委託プランを用意しています。(5)「シーケンス解析のみ」は調製済みのライブラリーについて、シーケンス解析のみを実施するというものです。これら委託サービスを適宜組み合わせていただくことで、複数のライブラリーを調製して1つのセルで解析したり、1つのライブラリーを複数のセルで解析する、というプランを実施することが可能です。
原則として、シーケンシングはラン開始から連続72時間実施します。「(6)フローセル洗浄とライブラリ再ロード」を追加し、間に入れることで、ポアの活性を回復し、データ収量を増やすことができる場合があります。なお、「(1)ウルトラロングリードDNA解析」の場合は、解析サービス内で「フローセル洗浄とライブラリ再ロード」を実施いたします。