ゲノムDNA抽出
概要
凍結細胞ペレットをご提出いただき、ゲノムDNAを抽出するサービスです。抽出後のゲノムDNAのFemto PulseによるQCも含まれています。
使用する方法によって、分子量が異なるゲノムDNAを抽出します。特別な理由がなければ、より高分子のゲノムDNAが得られるガラスビーズ法を推奨します。
- 細胞試料からのゲノム抽出（アルコール沈澱法）
Promega社のWizard® Genomic DNA Purification Kit （#A1120）を使用してゲノムDNA抽出します。 - 細胞試料からの高分子ゲノム抽出（ガラスビーズ法）
NEB社のMonarch® HMW DNA Extraction Kit for Cells & Blood（#T3050）を使用してゲノムDNA抽出します。
抽出後のゲノムDNAの例（Femto Pulse）
- 内規上の名称：
細胞試料からのゲノム抽出（アルコール沈澱法）
細胞試料からの高分子ゲノム抽出（ガラスビーズ法）
提出サンプル要件
細胞ペレット
- 細胞に合った方法で剥離後、PBS等でwash、ペレットにして液体窒素で凍結後、ドライアイス便でお送りください。
- 1本の1.5 mlチューブあたり10万細胞以上でご提出ください。
- 可能であれば細胞ペレット2本以上のご提出をお願いいたします。
- 抽出されたゲノムDNAを、SignACのEM-seq、PacBio全ゲノム解析、ONT DNAシーケンス解析のいずれかの受託解析を依頼される場合にのみ受付可能なサービスです。
納品物
ゲノムDNA（ほかの受託解析に使用されて残らない可能性があります）
DNA QCレポート（pdf）
納品物（ゲノムDNA）の送付は原則としてSignACまで取りに来ていただくか、着払いでのお受け取りをお願いします。
納期
お問い合わせください。
参考
サンプルを受け取ってから4週間程度